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基因组所动物功能基因组学创新团队诚聘生信工程师、科研助理

2022-06-02 07:45:43来源:

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基因组所介绍

中国农业科学院深圳农业基因组研究所(简称“基因组所”)成立于2014年,由农业农村部、中国农业科学院和深圳市政府共同支持建设。基因组所通过整合生物学和大数据科学,来认识与利用农业生物基因组,服务全球农业生产。为此,基因组所成立了组学技术、合成生物学、植物基因组、动物基因组、生态基因组、食品科学等研究中心和相关技术平台?;蜃樗某て谠妇笆侵铝τ谕ü吒残源葱吕创俳蚺┮悼沙中⒄?,服务于个性化食品供给体系,并提升人类健康水平和农民社会地位!

成立以来,基因组所深入贯彻落实习近平总书记“四个面向、两个一流”指示精神,开展科研自主权改革试点工作,被列为中国农科院现代院所改革的“试验田”,建立了由中国农科院与深圳市主管领导任共同理事长的理事会;组建了1000多人的研究队伍;形成了以组学技术为核心、辐射农业、食品和生态方向的学科体系,获批“岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心”“农业农村部农业基因数据分析重点实验室”等创新载体;在包括Science、Nature、Cell等顶级期刊在内的杂志上发表SCI论文400多篇,以基因组设计育种育成国审、省审新品种30余个,农业基因组学等研究领域占据世界前沿。2019年以来连续三年自然指数排名全国农业类科研院所第一名,多项成果入选“‘十三五’农业科技十大标志性成果”“中国生命科学十大进展”“中国农业科学十大进展”。先后获得“何梁何利基金”奖、“周光召基础科学奖”“深圳经济特区建立40周年创新创业和先进模范人物”“深圳市市长奖”等奖励。


动物功能基因组学创新团队介绍

团队首席:Yubo Zhang,研究员,博士生导师,国家重大人才工程入选者,广东省高层次人才,深圳市高层次人才,动物功能基因组学创新团队首席科学家,主要研究领域为三维基因组学和动物遗传育种学。

团队骨干:孔思远,副研究员,硕士生导师,国家“博士后创新人才支持计划”、深圳市优秀科技创新人才培养项目(博士启动)入选者,动物基因组中心Pre-PI。


动物功能基因组学创新团队是国家前沿人才引进团队,专注于探索远距离基因互作、非编码DNA调控元件对基因转录调控的影响,构建动物三维转录调控网络,探索研究三维基因组学相关技术在畜牧学上的应用,揭示影响中外猪种、牦牛产肉、繁殖、营养等重要经济性状形成的新机制。改良或发展了三维基因组学技术和表观组学技术,如ChIA-PET、Hi-C、MAE-seq、MNase ChIP-seq、Multi-ChIP、TSS-seq等方法。团队成员已在Nature、Nature Genetics、PNAS和Nucleic Acids Research等高水平杂志发表论文多篇。研究成果还被干细胞参考书网站收录为参考文献(http://www.stembook.org/node/3443)。

本课题组研究经费充足,团队平台成熟。在团队首席科学家领导下,形成了由PI、Pre-PI、博士后、科研助理、博士、硕士研究生、本科实习生等人员组成的科研团队。团队同国内外不同实验室建立了合作关系,包括中国科学院、上海交通大学、美国国立卫生研究院、劳伦斯伯克利国家实验室和荷兰瓦赫宁根大学等。团队拥有广泛的国内外合作网络,可为课题组工作人员提供良好职业发展前景。


团队近年发表论文(部分):

1. Yubo Zhang, Chee Hong Wong, Ramon Birnbaum, GuoliangLi, Rebecca Favaro, Chew Yee Nyan, Eunice Tai, Joanne Lim Hui Ping, Huay MeiPoh, Fabianus Hendriyan Mulawadi, Silvia Nicolis, Nadav Ahituv, Yijun Ruan andChia-Lin Wei. Dynamic chromatin connectivity maps reveal lineage specificregulation. Nature. 2013, 504, 306-310.

2. Siyuan Kong, Qing Li, Gaolin Zhang, Qiujia Li,Qitong Huang, Lei Huang, Hui Zhang, Yinghua Huang, Yanling Peng, Baoming Qin, Yubo Zhang , Exonuclease combinations reduce noises in 3D genomics technologies. Nucleic Acids Research, 2020, gkaa106, https://doi.org/10.1093 /nar/gkaa106.  

3. Kamada R, Yang W, Zhang Y, Patel MC, Yang Y, Ouda R,Dey A, Wakabayashi Y, Sakaguchi K, Fujita T, Tamura T, Zhu J, Ozato K.,Interferon stimulation creates chromatin marks and establishes transcriptionalmemory. Proc Natl Acad Sci., 2018, 115(39):E9162-E9171 doi:10.1073/pnas. 1720930115.

4. Kong, S. & Zhang, Y. Deciphering Hi-C: from 3Dgenome to function. Cell Biol Toxicol. 2019, Feb, 35(1):15-32.

5. Li, D., Huang, Q., Huang, L, Zhang Y. et al. Baiting out a full length sequence from unmapped RNA-seq data. BMC Genomics, 2021, 22, 857. https://doi.org/10.1186/s12864-021-08146-4.

6. Peng Y, Kang H, Luo J, Zhang Y. A Comparative Analysis of Super-Enhancers and Broad H3K4me3 Domains in Pig, Human, and Mouse Tissues. FRONT GENET. 2021,12. doi:10.3389/fgene.2021.701049.


一、招聘岗位

根据团队工作需要,拟招聘:

1. 生信工程师 1名

2. 科研助理 1-2名


二、应聘条件

(一)生信工程师

1. 获得生物信息学相关专业硕士及以上学位,基因组学、生物信息学、数学、生物学、物理学、计算机科学或相关专业背景;有相关工作经历者可放宽学历条件。

2. 有组学数据生信分析学习工作经历,熟悉Linux操作系统,至少掌握R、Python和Perl等语言中的一种,优先考虑发表过组学相关SCI论文且作者贡献为生信分析的申请者。

3. 诚实守信、认真负责、积极主动,自主学习能力强、执行能力强,具有良好的团队合作意识与沟通能力。

4. 具有较好的英文听说能力,能熟练阅读专业文献,具有较强的中英文写作能力。

(二)科研助理

1. 获得生物、农业、医学等生命科学等相关专业硕士及以上学位,有相关工作经历并计划从事科研相关工作者可放宽至学士学位。

2. 工作积极主动、认真负责、耐心细致、执行能力强,具有分子生物学及细胞生物学基础实验技能、熟悉基本分子生物学相关仪器操作者优先考虑。

3. 有积极的科研热情、良好的沟通能力和团队精神。


三、岗位职责

(一)生信工程师

1. 在团队首席和团队骨干的具体指导下进行相关工作,开发或利用已有流程和软件进行大数据分析,整理绘制相关图表。

2. 进行高水平论文生物信息流程、分析部分的中英文写作。

(二)科研助理

1. 协助团队骨干进行前沿组学核心技术研发,优化方法、建立流程等相关实验工作。占工作内容约70%。

2. 协助维护团队实验室运转,负责相关设备的保养与维护、人员培训等。占工作内容约10%。

3. 协助团队首席及团队骨干准备学术材料,参与辅助申请相关专利、科研项目,完成交办的其他工作相关事务。占工作内容约20%。


四、薪资待遇

1. 提供具有市场竞争力的薪资待遇,根据能力、经验和业绩面议;提供优厚年终奖金,根据当年工作态度、业绩进展确定。其他相关待遇、社会保险及公积金按照深圳市及研究所有关规定执行。

2. 符合条件的可选择落户深圳市,并且享受深圳市人才生活和租房补贴,具体以深圳市政府最新规定为准。

3. 提供良好的工作环境和充足的研究经费,配备精良的实验仪器。

4. 提供良好的科研环境和深造学习培训的机会,表现优异可协助推荐到国内外知名科研单位、高等院校深造学习和开展科研合作。


五、申请方式

申请者请将个人简历(包含教育背景、学习工作经历、研究成果或实验室研究经历等)以电子邮件形式发送至:kongsiyuan@caas.cn,并抄送zhangyubo_lab@163.com

邮件主题和材料压缩文件请注明:姓名-岗位名称应聘

应聘者材料将严格保密,通过简历筛选者将安排面试,未进入面试者,不再另行告知。



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