赵程课题组

Cheng Zhao Lab

　　课题组长

　　赵程，研究员，博士生导师。2018年于美国德克萨斯农工大学获得博士学位，2018-2021年于斯坦福卡内基科学研究所从事博士后研究，2021年9月加入中国农科院基因组所合成生物学研究中心，致力于人工智能与代谢网络建模研究。以第一作者或通讯作者在Nature Communication、Green Chemistry、ACS Synthetic Biology等多个国际学术期刊上发表高质量论文数篇，并授权多项发明专利和软件著作权。

 

　　工作经历

　　2021.9 - 至今       中国农科院深圳农业基因组研究所      研究员

　　2018.7 - 2021.7   美国卡内基科学研究所                       博士后

 

　　教育经历

　　2013.8 - 2018.8      美国德克萨斯农工大学    博士

　　2009.9 - 2013.6      武汉大学                        学士

 

　　研究方向

1. 利用基因组规模代谢网络模型，模拟植物代谢过程，预测限制目标代谢物产量的关键反应，设计天然产物的代谢途径。

2. 基于大语言模型框架，开发针对合成通路设计的人工智能大模型。

本课题组常年招收博士后和其他科研岗位，具体招聘信息请点击http://www.012652.cn/rczp/zpxx/293732.htm 

Selected Publication

 *Co-first author, #Corresponding author

1. Peng, Q.*, Zhao, C.*, Wang, X., Cheng, K., Wang, C., Xu, X., & Lin, L. (2025). Modeling bacterial interactions uncovers the importance of outliers in the coastal lignin-degrading consortium. Nature Communications, 16(1), 639.

2. Lei, Li., & Zhao, C. (2025). Large language model applications in nucleic acid research. Genomics Communications 2: e003.

3. Gao, Y., & Zhao, C. (2024). Development and applications of metabolic models in plant multi-omics research. Frontiers in Plant Science, 15, 1361183.

4. Wang, Y., Jing, X., Gao, Y., Han, X., Zhao, C.#, & Pan, W.# (2024). Leaf rolling detection in maize under complex environments using an improved deep learning method. Plant Molecular Biology, 114(5), 92.

5. Li, C., Huang, W., Han, X., Zhao, G., Zhang, W., He, W., Nie, B., Chen, X., Zhang, T., Bai, W., Zhang, X., He, J., Zhao, C., Fernie, A., Tschaplinski, T., Yang, X., Yan, S., Wang, L. (2023). Diel dynamics of multi-omics in elkhorn fern provide new insights into weak CAM photosynthesis. Plant Communications, 4(5).

6. Zhao, C., Kim, Y., Zeng, Y., Li, M., Wang, X., Hu, C., ... & Yuan, J. S. (2018). Co-compartmentation of terpene biosynthesis and storage via synthetic droplet. ACS synthetic biology, 7(3), 774-781.

7. Zhao, C., Xie, S., Pu, Y., Zhang, R., Huang, F., Ragauskas, A. J., & Yuan, J. S. (2016). Synergistic enzymatic and microbial lignin conversion. Green chemistry, 18(5), 1306-1312.

Patent

1. Yuan JS, Zhao C. The Texas A&M University System. Increasing plant bioproduct yield. World Patent WO2019139616A1. 2019 July 18.

　　赵程课题组更新于2025年3月