程旭课题组

Cheng Xu’s Lab

chengxu@caas.cn

课题组长

程旭，研究员，博士生导师，深圳市“海外高层次人才”，中国微生物学会会员，国家微生物种业产业技术创新战略联盟成员。

2001年就读于中国农业大学，2003年底开始在荷兰瓦赫宁根大学先后获得了学士、硕士和博士学位。2014年-2020年在瓦赫宁根大学从事博士后研究，并组建根际微生物组研究团队。研究领域包括土壤和根系微生物组学、根系有益微生物保护植物健康、促进植物生长的作用机理，构建复合微生物菌群并使其提高植物耐盐能力和菌根真菌菌丝际微生物对植物生长的影响等。目前，在The ISME Journal，Environmental Microbiology，New Phytologist和Nature Plant等国际学术期刊上发表SCI论文20余篇，获得授权国家专利5项。2021年12月，加入合成生物学研究中心经济作物的全基因组设计育种创新团队，从事土壤和根系微生物组的研究，挖掘微生物组对马铃薯健康保护、生长促进的作用机理和应用技术，结合微生物组结构和功能研究，开发植物育种的新思路和新方法。

工作经历

2022/04 至今               中国农业科学院深圳农业基因组研究所            研究员（PI）

2021/12 – 2022/03      中国农业科学院深圳农业基因组研究所            Pre-PI

2020/06 – 2021/08      荷兰瓦赫宁根大学                                          Guest Scientist

2014/06 – 2020/05      荷兰瓦赫宁根大学                                          博士后

2013/10 – 2014/02      美国加州大学圣地亚哥分校                             访问学者

2009/01 – 2009/07      美国康奈尔大学                                              研究助理

教育经历

2010/03 – 2016/09     荷兰瓦赫宁根大学 博士研究生

2003/12 – 2009/08     荷兰瓦赫宁根大学 学士和硕士研究生

2001/09 – 2003/08     中国农业大学 本科

研究方向

（一）作物栽培学。本课题组目前以马铃薯为主要材料，专注于促进杂交二倍体马铃薯种子萌发和育苗壮苗技术的研发和创新；通过土壤改良、水-肥-药一体化的栽培和管理技术研发和创新，从而提高杂交马铃薯产量和品质。

（二）土壤和植物微生物组学。土壤和植物根系存在着成千上万种微生物，具有丰富的多样性，并与植物的生长和健康息息相关。本课题组将通过宏扩增子、宏基因组结合代谢组等多组学技术深入研究马铃薯根系微生物组组成结构、丰度和功能；通过分析核心和基石类菌群等，构建复合微生物群落，揭示其对马铃薯促生和提高逆境胁迫能力的作用机理。

研究进展

成功完成杂交二倍体马铃薯的规模性田间试种；初步构建了杂交马铃薯配套栽培技术体系；发掘微生物资源和技术对杂交马铃薯的有益功能，建立了种子、幼苗与有益微生物互作的研究体系，并获得显著性促进种子萌发和幼苗根系生长的菌株。

代表论文

1. Schmitz L, Yan Z., Schneijderberg M., de Roij M., Pijnenburg P., Zheng Q., Franken C., Dechesne A., Trindade L., van Velzen R., Bisseling T., Geurts R.?, and Cheng X.? (2022). Synthetic bacterial community derived from a desert rhizosphere confers salt stress resilience to tomato in the presence of a soil microbiome. The ISME J. 8:1907-1920. (*Co-corresponding authors).

2. Schneijderberg M, Cheng X.*, Franken C., de Hollander M., van Velzen B., Schmitz L., Geurts R, van der Putten W.H., Bezemer T.M. and Bisseling T.* (2020). Quantitative comparison between the rhizosphere effect of Arabidopsis thaliana and co-occurring plant species with a longer life history. ISME J. 14: 2433–2448. (*Co-corresponding authors).

3. Cheng X., Etalo DW, van de Mortel JE, et al. (2017). Genome-wide analysis of bacterial determinants of plant growth promotion and induced systemic resistance by Pseudomonas fluorescens. Environ Microbiol., 19(11):4638-4656.

4. Cheng X., Cordovez V, Etalo DW, van der Voort M, Raaijmakers JM. (2016). Role of the GacS Sensor Kinase in the Regulation of Volatile Production by Plant Growth-Promoting Pseudomonas fluorescens SBW25. Front Plant Sci., 7:1706.

5. Cheng, X., van der Voort, M. & Raaijmakers, J. M. (2015). Gac-mediated changes in pyrroloquinoline quinone biosynthesis enhance the antimicrobial activity of Pseudomonas fluorescens?SBW25. Environ Microbiol Rep., 7, 139–147.

6. Cheng X.Irene de Bruijn, Menno van der Voort, Joyce E. Loper and Jos M. Raaijmakers (2013). The Gac Regulon of Pseudomonas fluorescens SBW25. Environ Microbiol Rep., 4,608-19.

5. Zhong Y, Xun W, Wang X, Tian S, Zhang Y, Li D, Zhou Y, Qin Y, Zhang B, Zhao G, Cheng X, Liu Y, Chen H, Li L, Osbourn A, Lucas WJ, Huang S, Ma Y, Shang Y. Root-secreted bitter triterpene modulates the rhizosphere microbiota to improve plant fitness. Nat Plants. 2022 Aug;8(8):887-896. doi: 10.1038/s41477-022-01201-2. Epub 2022 Aug 1. PMID: 35915145.

6. Li Q, Li H, Yang Z, Cheng X, Zhao Y, Qin L, Bisseling T, Cao Q, Willemsen V. Plant growth-promoting rhizobacterium Pseudomonas sp. CM11 specifically induces lateral roots. New Phytol. 2022 Aug;235(4):1575-1588. doi: 10.1111/nph.18199. Epub 2022 May 27. PMID: 35510807; PMCID: PMC9546010.

代表专利

1. 程旭,秦岭, 曹庆芹, 安东尼·比斯利, 一种桔黄假单胞菌CM-6及其应用, 2021-05-25, 中国, ZL202 010988747.8.

2. 程旭, 曹庆芹, 秦岭, 安东尼·比斯利, 一种桔黄假单胞菌CM-7及其应用, 2021-08-10, 中国, ZL202 010988734.0.

3. 秦岭,程旭,曹庆芹, 安东尼·比斯利, 一种桔黄假单胞菌CM-8及其应用, 2021-04-23, 中国, ZL202 010990368.2.

4. 曹庆芹, 程旭, 秦岭, 安东尼·比斯利, 一种桔黄假单胞菌CM-9及其应用, 2021-04-23, 中国, ZL202 010990366.3.

5. 李茜, 程旭, 曹庆芹, 秦岭, 安东尼·比斯利, 赵亚层, 一种假单胞菌CM-11及其应用, 2021-11-23, 中国, ZL202011555790.1.  

程旭课题组更新于2023年3月