基因组所介绍

　　中国农业科学院（深圳）农业基因组研究所（简称“基因组所”），是中国农业科学院和深圳市共同举办的新型国家级研究所。成立四年来，践行“跃居世界农业科技高端，服务产业重大科技需求”国家使命，服务于粤港澳大湾区战略部署和深圳市国际科技产业创新中心建设，打造了国际领先的“种质资源收集 — 基因组测序和分析 — 功能基因挖掘 — 分子设计育种”的全链条创新平台；引进了40余位具有国际竞争力的PI，累计招收博士后130多名；在农业生物组学基础、基因组学与动植物分子育种、基因组学与动植物健康等方向取得了突出成果，在Science、Nature、Cell、Nature Genetics等知名期刊上发表SCI论文300余篇，奠定了我国农业基因组学的国际地位。

　　

　　程时锋课题组简介

　　中国农业科学院（深圳）农业基因组研究所（简称“基因组所”）合成生物学研究中心程时锋团队致力于植物比较进化基因组学、作物群体遗传学、和关键性状起源和演化机制的多组学ENCODE研究。　

　　近年来重点关注trait-based的Phylo-GWAS研究方法、大规模比较进化基因组学、作物群体大数据gene-trait关联和连锁研究方法，如开发多倍体作物（小麦、燕麦等）群体多样性绘制(包括Pan-genome、Pan-SV和Pan-NLRome)和及高效的GWAS关联分析基因发现工具和算法，包括开发kmer-based GWAS,PAV/SV-GWAS, eGWAS, mGWAS等。

　　主要项目包括：（1）“谷-豆”国际基因组联盟计划（http://www.g3rp.com/）下的禾本科作物和豆科豆类比较基因组和群体基因组；（2）结瘤生物固氮分支N-fixing Root NoduleSymbiosis祖先新性状起源与多样性演化的基因表达表观调控机制；（3）C4高光合大规模比较进化基因组学，及其起源和平行演化的基因表达表观调控机制。团队先后参与完成了多个重大项目，相关研究结果发表在Cell、Science、Nature Genetics、Nature Biotechnology、Gigascience、Plant Cell、Plant Journal等知名国际期刊上。目前拥有团队成员15名，主要来自计算机科学、基因组学、生物信息学、植物分子生物学、进化与群体遗传学等多个学科。

 

　　01 招聘需求　

　　1. 生物信息学算法开发博士后1名。

　　2. 生物信息学算法开发工程师1名。

　　3. 植物进化基因组、多组学和群体遗传信息大数据分析博士后1名。

　　4. 田间育种专员1名。

　　　　

　　02 岗位职责

　　生信及算法/工具开发：

　　1. 基因组功能元件、序列模型预测深度学习算法、流程开发。

　　2. 植物大规模系统比较进化基因组学方法构建。

　　3. 开发群体遗传学单倍型多样性挖掘及基因发现新方法。

　　4. 利用深度学习等算法整合基因大数据，开发表征量化可视化方法，开发数据库，建设网站在线分析工具。

　　

　　田间育种专员：

　　1. 作物田间实验设计、规划和管理。

　　2. 作物表型鉴定、组织/核酸/材料提取等样本文库制备。

　　

　　

　　03 应聘条件　　

　　博士后：

　　1. 博士学位，数学、计算机科学、数理统计、生物信息学、物理学、基因组学等相关专业；熟练使用Linux系统，至少熟练掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等语言中的两种。

　　2. 勤于思考，能独立开展课题研究，学术态度严谨，善于团队合作。

　　3. 良好的沟通能力和中英文科技写作能力。

　　4. 不超过35周岁，近3年在国际学术刊物以第一作者发表过或即将发表SCI论文。

　　

　　生信算法开发工程师：

　　1. 985/211本科毕业，生物信息学或计算机专业。

　　2. 熟练使用Linux系统，至少熟练掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等语言中的两种。

　　3. 有相关工作经验者优先。

　　

　　田间育种专员：

　　1. 硕士及以上学历，育种相关专业，具有作物（小麦优先）育种相关的理论知识。

　　2. 1年以上从事作物育种的工作经验，如作物品种的选育。

　　3. 具有一定的计算机运用能力，能独立完成数据收集、录入和分析。

　　4. 工作认真，有责任感，执行力强，工作效率高；良好的沟通能力和团队协作能力。

　　5. 英语写作和口语优秀者，优先考虑。　

　　

　　04 岗位待遇　

　　博士后：

　　1. 在站期间享受深圳市和大鹏新区的在站博士后生活补贴，共计税后60万元。

　　2. 按照研究所的相关规定提供博士后的工资、五险一金和绩效待遇。

　　3. 博士后人员进站后，可选择落户深圳市，其配偶及未成年子女可办理随迁入户，并且享受深圳市和大鹏新区的新引进人才生活补贴，共计税后6万元。

　　4. 博士后在站期间鼓励申报中国博士后基金、国家自然科学青年基金，项目结题且出站后留深工作的可认定为深圳市后备级高层次人才，奖励160万，若在大鹏新区工作，另有1:1配套补贴。

　　

　　生信算法开发工程师、田间育种专员：

　　1. 薪资待遇面议，相关社会保险及公积金按照深圳市有关规定执行。

　　

　　

　　05 申请方式　　

　　申请者请将个人简历（包含教育经历、研究经历、论文发表）、代表作和研究意向以电子邮件形式发送至：chengshifeng@caas.cn，邮件主题和材料压缩文件请注明“姓名+申请职位名称”。

　　研究所会仔细分析并保密所有申请资料，并在收到申请的一个月内与初审合格者电话或E-mail联系，安排面试；资格审查未通过者，不再另行告知。

　　　

　　程时锋代表论文

　　1. Cheng S*, Xian W, Fu Y, et al. Genomes of SubaerialZygnematophyceae Provide Insights into Land Plant Evolution. Cell, 2019,179(5): 1057-1067. e14.

　　2. Griesmann M, Chang Y, Liu X, et al. Cheng S?. Phylogenomicsreveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis[J]. Science,2018, 361(6398): eaat1743.

　　3. Cheng S*, Melkonian M, Smith SA, et al. 10KP: Aphylodiverse genome sequencing plan. Gigascience. 2018;7(3):1–9.

　　4. Cheng S*, Gutmann B, Zhong X, et al. Redefining thestructural motifs that determine RNA binding and RNA editing bypentatricopeptide repeat proteins in land plants. Plant J.2016;85(4):532–547.

　　5. Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodiniumkawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science.2015;350(6261):691–694.　

　　6.Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. TheTarenaya hassleriana genome provides insight into reproductive trait and genomeevolution of crucifers. Plant Cell. 2013;25(8):2813–2830.　

　　7. Zhang, G., Liu, X., Quan, Z. Cheng S*. et al. Genomesequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grassevolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30, 549–554 (2012).