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叶国友课题组

叶国友课题组

Ye Guoyou Lab


课题组长

叶国友,研究员,博士生导师。现任CAAS-IRRI基因组辅助种质创新联合实验室主任和IRRI高级科学家II。多年来一直从事植物遗传育种相关研究,在群体改良、分子育种、育种方案设计、遗传分析和遗传育种软件开发等方面有重要建树。在国际刊物发表研究论文90余篇,参与编写论著1部。是Frontiers in Plant Sceince、BMC Genetics、Crop Journal和Rice Science编委。


工作经历

2016.4-至今           中国农业科学院深圳农业基因组研究所/国际水稻研究所    高级科学家/CAAS-IRRI联合实验室主任

2009.1-2016.4       国际水稻研究所                                                               高级科学家 

2005.7-2009.7       澳大利亚维多利亚洲初级产业部                                       高级科学家   

2005.7-2009.7       昆士兰大学                                                                      研究人员     

2000.10-2001.7     新西兰作物和食品研究中心                                              研究人员   

1990.12-1995.2     林业部泡桐研究开发中心                                                 研究人员   

      

教育经历

1997.03-2001.04      林肯大学                       博士              

1986.08-1989.06     北京林业大学                 硕士                

1982.08-1986.06     北京林业大学                 本科   

      

团队研究方向

以水稻为目标作物建立全基因组水平选择与设计育种的信息管理,数据分析和育种设计平台。围绕关键要求利用基因组信息确定重要育种目标性状的有利基因和等位基因,引进和鉴定新的种质资源,开发分析方法和育种设计软件,获取基因型-表型关系信息,建立完整高效的种质创制技术体系。

 

研究进展

引进国际水稻种质7000多份,在水稻耐盐性、离子营养积累/毒害,直播相关性状的遗传和育种等方面取得重要进展:完成了aus、indica群体苗期耐盐表型的测定工作;通过全基因组关联分析和反向遗传学的方法已经找到2个与耐盐相关的基因;定位到8个与籽粒镉累积相关的功能位点,获得12个候选基因;已经获得多个与镉累积相关的遗传群体;对多个候选基因进行了克隆;与IRRI合作获得了3个与籽粒锌累积相关的候选基因;获得 4个与水稻铝吸收转运的候选基因;对1000多份重测序种质进行中胚轴长度测定;通过关联分析定位到7个与中胚轴发育相关的功能位点,获得了15个候选基因;获得35个F1群体,26个F2群体。


Selected Publication

1. Zou W.L., Li C., Zhu Y.J., Chen J.G., He H.H et al (2019). Rice Heavy Metal P-type ATPase OsHMA6 Is Likely a Copper Efflux Protein. Rice Science 27

2. Chen J.G., Zou W.L., Meng L.J., Fan X.Y., Xu G.H. et al (2019). Advances in the Uptake and Transport Mechanisms and QTLs Mapping of Cadmium in Rice. International Journal of Molecular Sciences 20:3417-3433

3. Liu H.Y., Zhan J.H., Li J.L., Lu X., Liu J.D. et al (2019). Genome‐wide Association Study (GWAS) for Mesocotyl Elongation in Rice (Oryza sativa L.) under Multiple Culture Conditions. Genes 11

4. Zhan J., Lu X., Liu H., Zhao Q.J., Ye G.Y(2019). Mesocotyl Elongation, an Essential Trait for Dry Seeded Rice (Oryza sativa L.): A Review of Physiological and Genetic Basis. Planta 251:27

5. Luo, B., Chen, J., Zhu, L., Liu, Sh., Lu, H. et al (2018). Affinity Nitrate Transporter OsNRT2.1 Increases Yield and Manganese Accumulation in Rice Under Alternating Wet and Dry Condition. Frontiers in Plant Science 9:1192.

6. Liang, Y., Meng, L., Lin, X. Cui, Y., Pang, Y. et al (2018).QTL and QTL networks for cold tolerance at the reproductive stage detected using selective introgression in rice. PlOS ONE 13(9): e0200846.

7. Liu, H., Wang, W., He, A., Nie, L. (2018).uring Ripening in Dry Seeded and Transplanted Rice. rice science 25:279.

8. 邹文莉、冷语佳、李娇龙、孟丽君、叶国友、贺浩华和陈景光(2018).水稻镉积累的吸收与转运机制及镉胁迫相关 QTL定位的研究. 分子植物育种 16(24):1.

9. Meng,L., Wang,B., Zhao,X., Ponce,K., Qian,Q., Ye,G.(2017).Association mapping of Ferrous, Zinc, and Aluminum tolerance at the seedling stage in Indica rice using MAGIC populations.Frontiers in Plant Science 8:1-15.

10. Leng Y., Ye G., Zeng D.(2017).Genetic dissection of leaf senescence in rice.International Journal of Molecular Sciences 18:2686.

11. Liang,S., Wu,L., Ren,G., Zhao,X., Zhou,M., McNeil,D., Ye,G.(2016).Genome-wide association study of grain yield and related traits using a collection of advanced indica rice breeding lines for irrigated ecosystems.Field Crops Research 193:70-86.

12. Meng,L., Guo,L., Ponce,K., Zhao,X., Ye,G.(2016).Characterization of three indica rice multiparent advanced generation intercross (MAGIC) populations for QTL identification.

13. The Plant Genome 9:1-14.Meng,L., Zhao,X., Ponce,K., Ye,G., Leung,H.(2016).

14. QTL mapping for agronomic traits using multi-parent advancedgeneration inter-cross (MAGIC) populations derived from diverse eliteindica rice lines.Field Crops Research 189: 19-42.

 

叶国友课题组更新于2023年8月

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