胡冠菁课题组

　　Hu, Guanjing Lab

　　

　　课题组长

胡冠菁， 研究员，博士生导师。2006年本科毕业于北京大学，2013年博士毕业于美国爱荷华州立大学。2013至2020年继续在美国爱荷华州立大学生态、进化及有机生物学系Jonathan F. Wendel教授实验室从事棉属植物的进化遗传学和功能基因组学研究。迄今已发表SCI期刊论文34篇；以第一或通讯作者（含共同）发表SCI论文13篇，单篇最高影响因子14.919，累计影响因子超过70。近五年来，发表SCI期刊论文15篇（第一作者4篇），主持国家自然基金面上项目1项；受邀在国际学术会议进行专题报告4次，担任组织者1次；兼职担任国际期刊编委2项。

　　

　　工作经历

　　2020/09-至今            中国农业科学院棉花研究所及（深圳）农业基因组研究所，研究员

　　2018/09-2020/08     美国爱荷华州立大学, 助理科学家

　　2013/08-2018/08     美国爱荷华州立大学, 博士后

　　

　　学习经历

　　2006/09-2013/08       美国爱荷华州立大学      遗传学           博士

　　2002/09-2006/06       北京大学                       生物技术       本科

　　

　　研究方向

胡冠菁课题组以棉属植物重要农艺性状的遗传解析与育种应用为主要研究方向，采用进化系统生物学方法整合多维度与多组学研究手段，致力于解析复杂性状的遗传调控网络与干预机制，为高效精准育种提供理论依据。

围绕棉属植物进化基因组学和育种，主要开展以下研究工作：（1）棉属野生种质资源的发掘创新；（2）重大棉花品种形成及关键农艺性状的遗传解析。通过对多倍体基因组的细胞遗传学特性、序列变异、染色体结构、转录调控元件、以及动态表达谱进行系统生物学分析，我们将深入探索棉花纤维发育、棉籽油份合成、胁迫响应等重要生理机制在驯化改良过程中的演化机制以及全基因组网络调控基础。　　

　　

　　Selected Publication

Co-first author(s) indicated with pound “#”, and corresponding author(s) indicated with asterisks “*”

1. Dong, Y., *G. Hu, C.E. Grover, E. R. Miller, *S. Zhu, & *J.F. Wendel. 2022. Parental legacy versus regulatory innovation in salt stress responsiveness of allopolyploid cotton (Gossypium) species. The Plant Journal 111 (3): 872–87.

2. Hu, G., C.E. Grover, D. Yuan, J. Jareczek, Y. Dong, E. Miller, J.L. Conover, *J.F. Wendel. 2021. "Evolution and diversity of the cotton genome" in Cotton Precision Breeding, edited by M.U. Rahman, Y. Zafar and T.Z. Zhang. Springer International Publishing. 2021 June 09. [Invited Book Chapter]

3. Hu, G., C. E. Grover, M. A. I. I. Arick, M. Liu, D. G. Peterson et al., 2020 Homoeologous gene expression and co-expression network analyses and evolutionary inference in allopolyploids. Brief. Bioinform. bbaa35.

4. #Bao, Y., #G. Hu, C. E. Grover, J. Conover, D. Yuan et al., 2019 Unraveling cis and trans regulatory evolution during cotton domestication. Nat. Commun. 10: 5399.

5. Hu, G., and J. F. Wendel, 2018 Cis-trans controls and regulatory novelty accompanying allopolyploidization. New Phytologist 221: 1691–1700.

6. Dong, Y., G. Hu, J. Yu, S. W. Thu, C. E. Grover et al., 2019 Salt‐tolerance diversity in diploid and polyploid cotton (Gossypium) species. Plant J. 101: 1135-1151.

7. #Zhao, B., #J. F. Cao, #G. Hu, Z. W. Chen, L. Y. Wang, X. X. Shangguan, Ling-Jian Wang, Y. B. Mao, T. Z. Zhang, J. F. Wendel, X. Y. Chen. 2018. Core cis-element variation confers subgenome-biased expression of a transcription factor that functions in cotton fiber elongation. New Phytologist 218(3):1061-1075.

8. Hu, G., R. Hovav, C. E. Grover, A. Faigenboim-Doron, N. Kadmon et al., 2016 Evolutionary conservation and divergence of gene co-expression networks in Gossypium (cotton) seeds. Genome Biol. Evol. 8: 3765–3783.

9. Hu, G., J. Koh, M.-J. Yoo, S. Chen, and J. F. Wendel, 2015 Gene-expression novelty in allopolyploid cotton: a proteomic perspective. Genetics 200: 91–104.

10. Hu, G., J. Koh, M.-J. Yoo, D. Pathak, S. Chen et al., 2014 Proteomics profiling of fiber development and domestication in upland cotton (Gossypium hirsutum L.). Planta 240: 1237–1251.

11. Hu, G., J. Koh, M.-J. Yoo, K. Grupp, S. Chen et al., 2013 Proteomic profiling of developing cotton fibers from wild and domesticated Gossypium barbadense. New Phytol. 200: 570–582.

12. Hu, G., N. L. Houston, D. Pathak, L. Schmidt, J. J. Thelen et al., 2011 Genomically biased accumulation of seed storage proteins in allopolyploid cotton. Genetics 189: 1103–1115.

胡冠菁课题组更新于2023年8月